Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CartptP56388 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms