Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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