Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms