Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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