Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms