Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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