Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms