Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ptpn11P35235 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn11P35235 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ptpn11P35235 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ptpn11P35235 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ptpn11P35235 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn11P35235 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms