Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde6aP27664 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde6aP27664 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pde6aP27664 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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