Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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