Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms