Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ntf3P20181 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms