Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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