Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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PtprqP0C5E4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprqP0C5E4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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PtprqP0C5E4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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PtprqP0C5E4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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PtprqP0C5E4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprqP0C5E4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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