Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtaP09225 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LtaP09225 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LtaP09225 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LtaP09225 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtaP09225 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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