Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms