Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01641 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01641 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01641 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01641 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms