Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms