Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Prrt1O35449 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Prrt1O35449 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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