Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb3O35393 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb3O35393 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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