Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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LfngO09010 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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LfngO09010 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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LfngO09010 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LfngO09010 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms