Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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