Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5458L7N219 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms