Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm379J3QQ19 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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