Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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