Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms