Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm340F6RGI3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm340F6RGI3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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