Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3250E9Q1M3 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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