Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms