Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms