Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms