Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprfA2A8L5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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