Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stxbp4Q9WV89 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp4Q9WV89 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms