Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms