Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc3Q9QZC1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms