Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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