Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms