Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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