Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms