Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrnp35Q9D384 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms