Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms