Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY73

Mrpl44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl44Q9CY73 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl44Q9CY73 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms