Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmed5Q9CXE7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmed5Q9CXE7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmed5Q9CXE7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms