Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms