Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms