Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp2Q9CQ73 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms