Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms