Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms