Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b3Q921M3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b3Q921M3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms