Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms